L'Université Paul-Valéry œuvre à la construction d’une offre pédagogique (cours obligatoires, options, séminaires, ateliers…) destinée à fournir aux étudiants une solide culture générale sur les questions écologiques dans leurs aspects scientifiques, historiques, sociaux, politiques, culturels, linguistiques et juridiques.
Son originalité est de proposer des enseignements sur le vivant et l'environnement en partant des champs disciplinaires propres aux humanités, en privilégiant des approches systémiques trans et inter-disciplinaires des savoirs.
Les pratiques d'enseignement sont irriguées par des démarches pédagogiques innovantes (sciences participatives, pédagogies tête-corps-cœur, éducation socio-émotionnelle, approches narratives, apprentissage par l'action…).
L'université propose également à ses personnels une offre de formation dans le domaine du développement durable et de la responsabilité sociétale.